Osnova sekce

  • V tomto tematickém bloku se nachází všechny potřebné materiály k laboratorním cvičením v rámci Biochemie I.
    Zde v úvodu je ke stažení labbook se všemi protokoly na praktická cvičení. 

    Teorii (e-book), testy, videa a další materiály jsou k dispozici v individuálních sekcích rozdělených dle témat praktických cvičení.

    Laboratorní praktika: 

    • Bezpečnost práce a úvod do spektrofotometrie
    • Elektrochemické metody - Potenciometrie    
    • Optické metody – spektrofotometrie
    • Vlastnosti pufrů
    • Ovlivnění výsledků laboratorních vyšetření
    • Chromatografické metody
    • Obecné vlastnosti aminokyselin a bílkovin
    • Kinetika enzymových reakcí
    • Specifičnost enzymových reakcí


    Uplatnění znalostí vztahujících se k tématu: 

    Zkušební otázky Biochemie II VŠE:

    • Mechanismus účinku enzymů včetně kinetiky
    • Aktivita enzymů a její ovlivnění
    • Kyseliny a zásady, pH, pufry
    • Princip potenciometrického měření pH a koncentrace iontů
    • Zdroje variability laboratorních výsledků – preanalytické vlivy
    • Zdroje variability laboratorních výsledků – analytická fáze (pravdivost, preciznost)
    • Struktura bílkovin a z ní vyplývající fyzikálně chemické vlastnosti
    • Uplatnění chromatografických metod v medicíně
    • Princip spektrofotometrických měření

    Zde si můžete stáhnout Labbook. 

    Na praktikách můžete pracovat s elektronickou nebo tištěnou verzí. 

  • Cíl praktického cvičení:

    • Zopakovat si bezpečnost práce v laboratoři 
    • Osvojit si základy pipetování
    • Seznámit se se základními principy absorpční spektrofotometrie
    • Osvojit si základy UV/VIS spektrofotometrie

    Před praktickým cvičením je nutné:

    • Přečíst si BOZP a vyplnit test na 100%
    • Podívat se na videolekci Zařízení používaná v chemické laboratoři
    • Podívat se na videolekci Základy pipetování
    • Nastudovat si teoretický úvod do spektrofotometrie

    Přehled témat zkoušených/probíraných na praktickém cvičení: 

    • Spektrum elektromagnetického záření 
    • Podstata UV a VIS spektrofotometrie
    • Transmitance, absorbance, Lambertův-Beerův zákon

    • Bezpečnost a ochrana zdraví při práci

    • Na test máte neomezený počet pokusů, ale musí být splněn na 100%. Bez splněného testu nebudete vpuštěni na praktická cvičení. 

    • Videolekce: Zařízení používaná v chemické laboratoři

       

    • Videolekce: Základy pipetování

       

       

    • Zde naleznete teoretické podklady k prostudování na téma Optické analytické metody.

  • Cíl praktického cvičení:

    • osvojit si základy UV/VIS spektrofotometrie
    • Osvojit si způsoby výpočtu koncentrace ze získaných hodnot absorbance

    Před praktickým cvičením je nutné:

    • Vyplnit ostrý test alespoň na 80 % (tolerance 1 chybné odpovědi), k dispozici je cvičný test s neomezeným počtem pokusů
    • Podívat se na videolekci ke spektrofotometrii
    • Zopakovat si teoretický úvod do spektrofotometrie


    Přehled témat zkoušených / probíraných na praktických cvičeních:

    • základní optické metody
    • podstata UV a VIS spektrofotometrie
    • transmitance, absorbance, Lambertův-Beerův zákon
    • způsoby stanovení koncentrace neznámého vzorku, využití v praxi
  • Cíl praktického cvičení:

    • Zvládnout práci s potenciometrem včetně kalibrace
    • Zvládnout grafické určení bodu ekvivalence

    Přehled témat zkoušených/testovaných/probíraných na praktickém cvičení: 

    • základní elektrochemické metody (potenciometrie, typy elektrod – standardní a indikační pro neutralizační, oxidoredukční a srážecí titrace, bod ekvivalence
    • slabé kyseliny a zásady, výpočet pH, význam disociační konstanty
    • pufry – základní charakteristika, acetátový pufr – titrační křivka, kapacita pufru

  • Cíl praktického cvičení:

    • Připravit acetátový pufr o různých hodnotách pH a porovnat vypočtené hodnoty.  
    • Odhadnout kapacitu acetátového pufru. 
    • Porovnat pufrační kapacitu bílkovin, fosfátového pufru a destilované vody.
    • Ověřit si teoretické poznatky o měření pH, zvládnout základní laboratorní techniky

    Přehled témat zkoušených/probíraných na praktickém cvičení:

    • základní vlastnosti pufrů
    • možnosti měření pH pufru v závislosti na požadované přesnosti
    • pufry v biologických systémech
    • výpočet pH pro bikarbonátový pufr v podmínkách organismu
    • stanovení koncentrace HCO3- v praxi

  • Cíl praktického cvičení

    • Uvědomit  si podíl jedince na vzniku chyb v analytické fázi měření
    • Zdokonalit  se v pipetování
    • Zvládnout  různé způsoby ředění vzorku

    Přehled témat zkoušených/probíraných na praktickém cvičení

    • chyby preanalytické, analytické a postanalytické
    • přesnost a správnost metody
    • ředění roztoků –výpočty
    • ředění vzorků v praxi – možnosti
    • význam porovnávacího roztoku („slepý“ vzorek) ve spektrofotometrii
  • On-line forma výuky

    V rámci praktického cvičení z chromatografických metod je potřeba splnit tyto úkoly:

    1) Prostudovat materiály k danému tématu
    2) Vypracovat a odevzdat(nahrát) pracovní list (Kazuistika) zde v kategorii, do složky "Odevzdání úkolu-Chromatografie"

    • Odpovědi pište přímo do pracovního listu na vyhrazená místa
    • Nezapomeňte si pracovní list podepsat a uvést skupinu - nejlépe přímo v názvu nahrávaného souboru

    3) Úspěšně vyplnit ostrý test (5 otázek - pro splnění potřeba 4 správné odpovědi)

    Úkoly musí být splněny a odevzdány nejpozději do pátku (31.10.) do 20:00 hod.


    Cíl praktického cvičení:

    • ověřit si teoretické poznatky a seznámit se s moderními separačními metodami
    • osvojit si základy chromatografických metod

    Přehled témat zkoušených/probíraných na praktickém cvičení: 

    • přehled chromatografických metod
      - podle principu (adsorpční, rozdělovací, iontoměničová, gelová, afinitní)
  • On-line forma výuky

    V rámci praktického cvičení je potřeba splnit tyto úkoly:

    1) Prostudovat materiály k danému tématu
    2) Vypracovat a odevzdat(nahrát) pracovní list zde v kategorii, do složky "Odevzdání úkolu-Aminokyseliny+bílkoviny"
    • Odpovědi pište přímo do pracovního listu na vyhrazená místa
    • Nezapomeňte si pracovní list podepsat a uvést skupinu - nejlépe přímo v názvu nahrávaného souboru
    3) Úspěšně vyplnit ostrý test (5 otázek - pro splnění potřeba 4 správné odpovědi)

    Úkoly musí být splněny a odevzdány nejpozději do soboty (22.11.) do 20:00 hod.

  • Úkoly laboratorního cvičení:

    • Stanovte pH optimum pro β-fruktofuranozidázu
    • Posuďte vliv teploty na katalytickou aktivitu β-fruktofuranozidázy
    • Posuďte vliv koncentrace β-fruktofuranozidázy na její katalytickou aktivitu
    • Určete specifičnost β-fruktofuranozidázy

    Přehled témat zkoušených na laboratorním cvičení:

    • substrátová a kinetická specifičnost
    • vlivy zevního prostředí na aktivitu enzymů (pH, teplota, inhibitory)
    • pH optimum – význam pro trávicí enzymy
    • význam snížení či zvýšení teploty v medicínské praxi
    • inhibice kompetitivní a nekompetitivní (jedy)
    • význam allosterické inhibice v regulacích

  • Úkoly laboratorního cvičení:

    • Změřte a vyhodnoťte kinetické parametry reakce katalyzované laktátdehydrogenázou.
    • Z naměřených dat určete hodnoty maximální rychlosti (Vmax) a Michaelisovy konstanty (Km). 
    • Z naměřených dat určete aktivitu laktátdehydrogenázy ve vzorku séra 

    Přehled témat zkoušených na laboratorním cvičení: 

    • základní struktura enzymu
    • role kofaktorů v enzymové aktivitě
    • kinetika enzymových reakcí, charakterizace Michaelisovy konstanty (reakce 1. a 0. řádu), grafické vyjádření
    • jak se v praxi měří rychlost reakce (úbytek koncentrace substrátu, zvyšování koncentrace produktu)
    • charakterizace laktátdehydrogenasy a reakce, kterou katalyzuje

    Minitest - 5 otázek  se zaměřením na vlastnosti enzymů a kinetiku 
    Cvičný test v MOODLE kurzu níže

    • Zde je k dispozici souhrnné fórum pro Laboratorní metody - praktická cvičení. 
      V případě vložení dotazů, podnětů nebo připomínek nezapomeňte napsat o jaké téma se jedná. 

      (Učitel kontrolující aktivitu přidělen dle aktuální garance tématu)