Je to proces, který uspořádává soubory na trvalém paměťovém médiu tak, že jsou konzistentní, tvořeny jediným souvislým sledem sektorů. Tím zajišťuje rychlejší chod počítače a odstranění tzv. fragmentace, která vzrůstá průběžně při práci se soubory a jejímu vzniku nelze ve větší míře zabránit. Proto by se měla defragmentace provádět pravidelně - někteří odborníci doporučují 2-týdenní intervaly (max. 1 měsíc), u více využívaných počítačů je nutné defragmentaci provádět častěji. Lze ji uskutečnit prostřednictvím speciálních programů. Na počítačích PC jsou součástí mj. i operačního systému MS-DOS 6.0, aj.
Při defragmentaci lze soubory třídit i podle určitých kritérií. Doba trvání defragmentace disku závisí např. na velikosti disku či její frekvenci (čím častěji ji provádíme, tím kratší dobu trvá).
